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本来就不是暴君天使兽X·天人形态的对手，又无法与彩羽尼奥合体，阿卡迪兽·超究极体是在绝望中被消灭的。正因为如此，它爆发出了最残忍的战斗力。为了保护作为移动载具的神马兽，暴君天使兽X·天人形态最后硬接了阿卡迪兽一击神炬阵(God
torch)。闪耀最后光芒的分解之光甚至击破了暴君天使兽X·天人形态的奇迹之希望铠甲，令他受创不轻。
“陛下体内的状况不太好，被神矩阵(God
torch)破坏的部分引起了时空之力的躁动，其与圣邪之力的平衡已经被打破。”为暴君天使兽X·天人形态检查后，黛西皱眉道。
“也就是说网络进化已经维持不下去了吗？”暴君天使兽X·天人形态自语道。身为一个掌握高级程序语言的研究者，他对自身的情况同样了如指掌。网络进化，将人类与数码兽合体，进行矩阵级提升，本就不是能够持久的进化方式。能够坚持到现在，已经是陆峰和武之内素娜不断协调努力的结果了。
“但是接触进化之后，随着力量的衰落，陛下的情况会更加糟糕，最坏的结果，甚至会出现数码兽版的‘植物人’……”黛西噼里啪啦操作着电脑，最后给出结论。
“真是个坏消息~”暴君天使兽X·天人形态自嘲道。忽然一道视线被他察觉！
不，不是视线，而是一种被锁定的危险直觉！
抬头仰望，暴君天使兽X·天人形态的目光似乎看破了天空……
日本大阪都，网络管理局。山木满雄兴奋地点燃打火机，作为与数码VT公司合作的条件，他得到了启动人类防御计划的权利。现在，正是这个历史性的时刻！
“希泼诺丝就位，网络大炮正在充能！”小野寺惠清丽的声音传来。
“人类防御计划第二阶段预计将于三十分钟后展开。”凤丽花接着道。
二十分钟，充能40%……
十分钟，充能75%……
五分钟，充能96%……
“时间到了~！”山木满雄站起身来，“人类防御计划第二阶段，启动！”
“网路大炮充能完毕~！”小野寺惠重重按下发射钮，“发射！！”
数字空间，网络世界，十三根隐伏的紫色巨柱缓缓升起，将虚拟的网络世界以平面的形态抬升起来，形成包裹地球的天上之天！
紫色巨柱还在上升，当网络世界与数码世界的频率一致之时，紫色巨炮仿佛刺破了什么东西，以光的速度，急速向上离去。
而对数码世界而言，便是一道亮度极高的百米巨柱急速坠落，轰然落地，以无可匹敌的气势横扫一切！
因为网路大炮对数据资料的强大破坏能力，被紫色光柱扫过的区域寸草不生，被彻底洗成白地，只有飞扬的尘土在诉说网路大炮的暴虐……
一道网路大炮笔直地向着暴君国度而来，在紫色光柱穿透独立空间外膜的瞬间，暴君天使兽X·天人形态周身浮现十二颗紫色数码核，这些数码核爆发出璀璨的力量，护住暴君国度。
“人类世界，一定发生了什么事情……”黛西担忧道。
“虚拟层的天空被击碎了~！”暴君天使兽X·天人形态看到，数码世界六层天的表层，虚拟层（VirtualLayer）的天空几乎被完全破灭，透过蓝色天幕，能很清晰地看到一颗巨大的笼罩着无数数据代码的星球挂在高天——地球！
地球之外，有十三根紫色光柱射出，在数码世界来回扫荡！“人类……这是要灭绝数码兽吗！？”
弄明白了人类防御计划第二阶段可能造成的后果，就连黑崎美树也有些按捺不住：“连我都想狠狠揍一顿人类了~！”
美国，数码VT公司。
托马愤怒地给了彩羽尼奥一拳：“你这样做会杀死多少数码兽，你知道吗？”
“我不知道，这也不是我做的~”彩羽尼奥揉着脸上的拳印针锋相对：“这是山木满雄做的，是日本的政府行为，与我何干？”
“你以为我会信吗？”托马脸色冷然，“你报复不了暴君天使兽X，所以就要报复整个数码世界是吗！”
“随你怎么想~”彩羽尼奥转身推开门：“我不在乎！”
可恶~！托马一拳砸在桌子上。
“托马……”伽奥伽兽闪身出现在托马身后。
“伽奥伽兽，我们离开吧……”
托马与彩羽尼奥的合作是建立在让人类的生活与生存变得更加美好的基础之上，是为了让人类与数码兽在未来能够和谐相处。所以他接受了数码兽杂合技术，开发数码兽培育机，举办阳极驯兽师大赛，制订人类防御计划……
但现在，事情开始偏离他的初衷，彩羽尼奥也变得偏激独断。会造成这种误解，完全是因为托马并不知道彩羽尼奥最大的秘密——穿越平行空间！因为无法登上最巅峰而产生毁灭一切的报复心理，这是一个被打落尘埃的天之骄子的歇斯底里！
托马和伽奥伽兽离开了，失去阿卡迪兽的彩羽尼奥不承认自己的失败，最后的自尊让他没有对托马出手。公司里，藤本秀人看着托马离开，心中彷徨不定，他感觉这间公司越来越不能给他以温暖的感觉了。
“丽，我该怎么办？”藤本秀人喃喃自语，他觉得自己或许应该去欧洲寻找彩羽丽。
人类防御计划第二阶段，其实质是在地球外围的数字空间构造名为“网络世界”的防御圈。深入数码世界的十三台网路大炮不间断地对数码世界进行扫荡。其战略意义在于：进攻就是最好的防御！
解除网络进化的暴君天使兽X·混沌形态失去了几乎所有的活动能力，这种情况下，保留数码兽形态只剩下威慑作用。
网路大炮击穿虚拟层天空带来了一个彩羽尼奥意想不到的问题——极少数数码兽会通过网络大炮被卷入网络世界，继而获得进入人类世界的机会！为了修复网络大炮给数码世界造成的创伤，奈奈美强迫美树原诺伦与黑日女神进行组合，成为暴君国度的主机级人工智能。这样她就有能力对虚拟层的天空进行修复。用伊芙限制美树原诺伦，也能防止她获得力量后背叛暴君国度。
即便如此，单纯的天空仍然防不住网络大炮，紫色光柱依然在数码世界的大地上横行，但其威力已经削弱到了极点。起码，被外围扫中不再会有致命的危险。究竟是网路大炮的威力更强，还是天空的防御力更高，就是双方不断升级的过程。
最终在多尔芬与卡罗等一批科学家的研究下，在顽固兽的指导下，他们找到了一种将陆峰的精神从暴君天使兽X·混沌形态中剥离出来的方法。这就像当初濒临死亡的木村辉一一样，是纯粹的精神化身，但其进步之处在于，这个精神化身即使进入人类世界，也能借助物质离子化形成特异蛋白来构建身体。也就是所陆峰进入人类世界后所使用的身体本质上与数码兽所只用的身体是一样，是人形数码兽，而非完全的人类。
之所以要这么做，是因为陆峰判断数码宝贝第三部的剧情很可能要开始了——挂在天上的那个绿色球体和紫色光柱实在是太显眼了！陆峰不能确定第三部的故事被扭曲到了什么程度，但大致上肯定是符合动画剧情的。他不愿借其他人之手去关注松田启人的成长，穿越的事情更是秘密中的秘密。更何况，陆峰记得很清楚，之后的网络管理局会有一个“歼灭计划”，其与这次的网路大炮会有什么关系也很难说——山木满雄所获得技术与对数码兽的了解远远超过动画中，区区朱雀兽能否阻止他真的很难说……
平野小学，是大阪教育大学的附属小学，松田启人就在这里就读五年级。因为东京变成第三东京市，原先的淀桥小学自然不存在了。不过班主任浅沼奈美仍然是松田启人的老师，原来的校长黑泽清二成了平野小学的副校长。盐田博和、北川健太、加藤树莉也都一一就位，这就是所谓的剧情惯性吧。
对了，还有李建良和牧野留姬。因为牧野留美子的名气，找到牧野留姬的住址很简单。倒是李镇宇一家迟迟没有消息，让陆峰纠结了好一会儿。
咚咚咚咚~~~·
放学的钟声响起。
陆峰和武之内素娜找到松田启人的时候，基尔兽已经孵化出来。松田启人在中心公园里找了一个僻静的桥洞作为基尔兽的栖身之所。自从有了基尔兽，松田启人放学后都是最快一个出学校，再也不和盐田博和他们玩数码宝贝卡牌了。
话说这种数码宝贝斗牌游戏还是陆峰参与设计的。初中的时候，一个高富不帅的同学曾话费一个小时来教陆峰玩数码宝贝卡牌，可惜他实在是朽木不可雕，宁愿去玩游戏王，不过基本规则还是记得的。