13年10月23日冯玉祥和胡景翼、孙岳等控制北京后，即发出停战主和的通电，电云：
“国家建军，原为御侮，自相残杀，中外同羞。不幸吾国自民九以还，无名之师屡起，抗争愈烈，元气愈伤，执政者苟稍有天良，宜如何促进和平，与民休息。乃者东南衅起，延及东北，动全国之兵，枯万民之骨，究之因何而战？为谁而战？主其事者，恐亦无法作答。本年水旱各灾，饥荒遍地，正救死之不暇，竟耀武于城中，吾民何辜，罹此荼毒，天灾人祸，并作一时。玉祥等午夜彷徨，欲哭无泪，受良心之驱使，为弭战之主张，爰于十月二十三日决意回兵，并将合所属各军，另组中华民国民军，誓将为国民效用，如有弄兵好战，殃吾民而祸吾国者，本军为缩短战期起见，亦不恤执戈以相周旋。现在全军已悉数抵京，首都之区，各友邦使节所在，地方秩序，最关重要，自当负责维持。至一切政治善后问题，应请全国贤达，急起直追，会商补救之方，共开更新之局。所谓多难兴邦，或即在是。临电翘企，伫候教言！”
冯、胡等既然控制了北京，即派兵分守九门，布告安民。
曹锟这位可怜的总统，花了无数的力，挨了无数的骂，才做了一年的总统，就遇上兵变。当23日他接到冯军回撤的消息，真是热锅上的蚂蚁。冯回京后仍驻在北苑，也不去见曹锟，曹锟只好派国务总理颜惠庆移樽就教，到北苑见冯，征求他对时局意见。冯提出三项要求：
（一）颁停战令。（二）惩办主战人物及附和者。（三）召集全国各省代表会议，共决时局。
颜惠庆把冯的三点意见回报曹，曹没了主意，乃分府召集阁员会商。其实总统也好，阁员也好，都是釜中之鱼，除了接受，别无选择。会议结束后曹遂颁布停战令：
“比岁国家多难，兵祸相寻。本大总统受任之初，即以振导祥和为职志。耿耿此心，久经宣示有众。此次用兵东北，实出万不得已，而蕲望和平之志，未尝一日或渝。军兴经月，战衅未消。轸念痌瘝，至深恻怛！自下令之日起，两方军事着即停止进行，各守原防，听候中央筹议结束办法，其有抗令不遵者，仍当强行制止，以期促进和平，与民休息！”
同时发表两道命令：
一为：直鲁豫巡阅使吴佩孚免去本兼各职。特派吴佩孚为督办青海垦务。
二为：讨逆军总副司令均撤销。山海关一带军队责成王承斌、彭寿莘妥为维持，以资结束。
曹锟于10月25日就被困在总统府，阁员星散。31日曹接受冯玉祥的要求，以黄郛为国务总理。冯当时还有只除吴佩孚一人的想法，所以兵变后仍犹豫于拥曹否？可是黄郛认为曹因贿选，恶名尤甚于吴，既已兵变，就应该连曹锟一起驱逐。
11月3日曹锟遂被迫通电辞职。
在曹辞职之前，北京情势已面目全非。早在10月25日这天，冯的部队约二三十人哗噪冲入总统府，要见军需总监曹锐，这时因为兵变关系，曹的亲近都避入延庆楼，曹锐听说冯军要找他，就要出去，可是曹锟不许，他说：“这是总统官邸，他们怎可在此胡闹。”因此曹自己走出延庆楼，冯军见到曹锟，不由得有点肃然，曹说：“这是总统府，你们为何在此吵闹？如有事可请冯检阅使来。”冯军见总统这么说，就没了主意，领头的班长只好对总统敬礼，整军而退。可是走了不到二小时，又回来了，这次则不大客气，嚷着说：“总司令请四先生到总部去。”总司令是指冯玉祥，冯这时已组成中华民国军，自任总司令；四先生是曹锐，他是曹锟的兄弟，排行第四。国民军总部设北苑。
曹锟还要喝阻，可是曹锐却毅然表示愿意去一趟。他从身上掏出100多元银票，扔在桌上，愤然说：“我去，他们想从我身上挤出钱来，休想，一块钱也没有。”说着就打开衣柜穿马褂，一边穿一边就在衣柜中偷偷地吞了许多鸦片烟膏，曹锟和其他人都没有注意。曹锐一边向哥哥告辞，一边忍住眼泪，出门上了汽车。待车子开到冯的总部门口，卫兵把车门打开，曹锐已入昏迷状态，从车上滚了下来，抬入冯总部，冯叫军医急救，已经起死无术了。
冯玉祥兵变后的第二天，颜惠庆内阁提出总辞职（13年10月24日）。冯玉祥乃在北苑总部邀约有关人士共商维持政局步骤，决议组织临时内阁，仍请颜惠庆担任，颜不肯就，内阁中只有海军总长李鼎新、教育总长黄郛尚在。黄郛是冯兵变的幕后策划人，北京大事既然要由冯作主，冯自然支持黄，10月31日冯以曹锟名义下令准颜惠庆辞职，同时任命黄郛组织摄政内阁兼代国务总理。11月2日曹锟被逼通电，并咨旧国会参众两院宣告退职，将总统印信移交国务院，代理国务总理黄郛遂于11月5日宣告摄政总统职位。