明军船队在天亮前抵达了平安镇，但随后发生的情形让李维正和所有明军都有些难以置信，只见几千艘小渔船密密麻麻地出现在海面上，每艘渔船上都有渔民拿着土制刀枪和长矛向大船叫嚣，情绪异常激动，而在岸上，一千多名倭寇也同样全副武装，警惕地注视着大明水师的船队，他们的船只就停靠在岸边，已做好一切迎战的准备。
岸上的日本倭寇不足为虑，现在的倭寇和一二百年后战国时代的倭寇相比，无论武力、实力都大大逊了一筹，战国时代形成的倭寇主要来自日本各地方大名的军队和武士，属于职业军人，再加上日本人不畏死的武士道精神的大明日益衰落的军力，一百多年后的倭寇一直就是明军的劲敌。
但现在是明初，现在的倭寇只是日本九州一些由豪门家丁和海盗组成的乌合之众，他们中间还有不少大明亡命海洋的渔民，无论装备还是军事训练都大大弱于后来的倭寇，更何况现在是大明军队战斗力最强的时代，以二千明军之众歼灭小琉球岛上的一千多倭寇不费吹灰之力。
但让明军头疼的是这几千艘渔船，这些渔民绝大部分都是汉人，群情激昂，堵住了海面，大船撞上去，不知要翻掉多少渔船。
“大人，这些渔民必然是受到倭寇的蛊惑，属下去劝导他们。”一名百户上前请令道。
李维正点了点头，随即下令，“船队暂停！”
船队缓缓减速了，最后停在千艘小渔船面前，百户跳上一条小战船，向渔船驶去，海面上随即传来百户严厉的喝喊声：“我们是大明水师，特来剿灭倭寇，尔等是大明子民，不思报国，反倒助纣为虐吗？”
他话音刚落，渔船的长矛标枪纷纷向他射来，百户吓得急忙逃回了船舱。
“没有用的。”林潮的父亲慢慢出现在李维身旁，他长叹一口气道：“他们都是自愿的，倭寇盘剥虽狠，但至少还准他们下海捕鱼，而大明朝下海就是死罪，许多渔船被福建军船在海上遇见，立刻就枭首示众，你们这般气势汹汹来，对他们而言已经没有活路了，对我也一样，我背叛了他们，也不知该怎么活下去了。”
林父的眼睛里充满了失落和萧瑟，他摇了摇头，佝偻的身子缓缓向船舱走去，就在这时，岸上突然爆发出一片惊恐的喊声，火枪声大作，喊杀声、惨叫声此起彼伏，从陆路赶来的水师截断了倭寇的退路，聚集在海面的一千多倭寇没有提防，顿时乱成一团，大部分人都拼命向几十艘船上跑去。
海面上拦截军船的小渔船也乱成一团，渔民的家小都在镇上，明军掩杀而来，岂能不殃及池鱼，不少渔船已有调头的迹象，李维正见形势转向有利，他立刻命百户再喊上几句。
“前面渔船听着，我们大人见尔等可怜，不忍汉人相煎，最后再给你们一次机会，你们速调头离去，不追究你们罪责，否则，决不再轻饶。”
他连喊了几遍，海面上的渔船终于开始调头让路了，渔民们心急如焚地向岸边驶去，无论如何也要保住自己的妻子儿女，海面上变得空旷了，大明水师呈扇形包围了倭寇的海船，火炮轰鸣，硝烟弥漫，这一次明军配备的是开花弹，这是京师宝源局特别制造，用于海战尤为犀利，与尚是冷兵器时代倭寇相比，明军的火炮占据了绝对的优势，一时海面上爆炸声接连不断，碎木横飞，倭寇被炸得肢断躯残，鲜血染红了海岸，顷刻间，三十只艘倭寇船只便沉没了大半，巨大的宝船更是横冲直撞，一连撞翻了四五艘逃出包围圈的倭寇小船，海面到处是挣扎呼救的倭寇，却被冷冰冰的箭一个个射死在海上。
剿灭倭寇的战役进行得十分顺利，盘踞在平安镇的一千五百名倭寇只用了半天时间便已清剿完毕，除了数十人逃入深山外，其余大部分都死在海上，陆地上也死伤四五百人，被俘虏一百余人，但枪炮不长眼，也有两百多艘渔船逃避不及在战争中翻沉，李维正当即下令，将一百余名战俘全部处决，人头带回京城邀功。
但李维正随即便遇到了麻烦，怎么处置平安镇的渔民？这一带聚集了三千多户从澎湖列岛和福建沿海逃来的渔民，老老小小足有一万五六千人，按朱元璋颁布的禁海令，违令下海者死，既无法将他们运回去，那这一万多人应当就地枭首，可若杀掉他们，也就意味着台湾岛上的第一批汉人开拓者就将消失了。
李维正站在宝船上默默望着被驱逐到海边的成千上万的男男女女，许多女人还抱着孩子，年轻人搀扶着年迈的父母，他们站在海边，海风吹拂着他们的头发和衣襟，他们十分安静，一双双眼睛里充满了绝望的目光，他们都是无辜的普通百姓，曾经是大明子民，为了生存而背井离乡逃到这片没有禁海令的土地上，他们的动机远远没有达到背叛自己国家的程度，他们的动机很简单，只是为了生存，为了延续祖祖辈辈的生存方式，况且连倭寇都能容忍他们，他李维正又怎么下手屠杀自己同胞。